En primer lugar corrige el primer post que tienes en mayúsculas y ponlo en minúsculas que parece que estas gritando... antes de que algún moderador te de un toque de atención por ello.
En segundo lugar, dependiendo del tipo de acabado que quieras tener en la limpieza de tu motor puedes o no quitar la tapa. Lo unico que debes de tener cuidado en proteger el alternador y la bateria protegiendolo con un plastico para que no entre agua. Algunos ni siquiera tapan el alternador y no ha pasado nada

pero si lo tapas seguro que no pasa nada al igual que la batería.
Enjabona bien el motor déjalo unos minutos y aclaralo bien, procura no dar mucha presión de cerca y sobre todo con el bloque frió, no lo hagas en caliente para evitar contrastes de temperatura.
Usa jabones que no sean agresivos, en las tiendas especializadas tienes productos para ello, habrá gente que usa KHT de cocinas, fairy, desengranaste, etc... pero luego aparecen síntomas de oxido por el bloque etc...